Jexus可以同时用普通方式(PHP-CGI/PHP-FPM)以及.NET(Phalanger)方式支持PHP，为了不引起混淆，用.NET方式支持PHP时，要注意如下事项：

1、网站配置文件中的UsePHP的值为false，或者不用这一句。

2、网站配置文件中添加一行 ASPNET_Exts=php，说明php网页按ASP.NET处理，如果已经有这一项，就在末尾添一个php（用英文件逗号与已有扩展名分隔）。

3、Jexus启用.NET4工作模式（在jws.conf中添一行“Runtime=v4.0.30319”）。

4、在网站的web.config添加Phalanger有关配置。

在“<configuration>”下添加：

  <configSections>

    <section name="phpNet" type="PHP.Core.ConfigurationSectionHandler, PhpNetCore, Version=3.0.0.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=0a8e8c4c76728c71" />

  </configSections>

  <phpNet>

    <compiler>

      <!-- <set name="Debug" value="true" /> -->

    </compiler>

    <paths>

      <set name="DynamicWrappers" value="/tmp" />

      <set name="Libraries" value="Bin" />

    </paths>

    <classLibrary>

      <add assembly="PhpNetClassLibrary, Version=3.0.0.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=4af37afe3cde05fb" section="bcl" />

    </classLibrary>

  </phpNet>

在"system.web"中添加：

<httpHandlers>

  <add path="*.php" verb="*" type="PHP.Core.RequestHandler, PhpNetCore, Version=3.0.0.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=0a8e8c4c76728c71" />

</httpHandlers>

具体的配置实例参照